参劾一些苛待百姓，中饱私囊的官员。

而到了隆庆十四年，天下最关心的一件事情就是漕运的改革问题，按照朱载坖在隆庆十三年发布的诏书，隆庆十四年是第一年实行河海兼运的年份，今年运河漕粮二百万石，海运漕粮六百万石，不过今年还要起运隆庆十三年的秋粮，这也是一笔不小的钱粮，所以朱载坖专门下诏给总督漕运劳堪和巡视漕运右都御史卫尉寺卿张学颜，要求他们务必要严密组织，保证东南的起运秋粮和漕粮安全抵达京师。

但是千算万算，还是出事了，隆庆四年三月，总督漕运劳堪急报，从东南发出的漕船在淮安天妃闸、山东临清失事，损失船只800艘,溺人千余,失米226000石，巡视漕运右都御史兼卫尉寺卿张学颜奏报，漕船在在黄河北桃源、宿迁一带遇风,撞沉漕船50余只,撞伤船只200余艘,多名运军被淹死，失米11499石余,并席竹、松板、行李、什物全行漂没，官军死伤过百。

朱载坖得到奏报之后，当即召见阁部重臣，漕船在运河出事，并不稀奇，每年都会有大量的漕船在运河上因为各种各样的事情出事，朱载坖之前也收到过这样的奏报，甚至说每年都要收到不少这样的奏疏，但是像今年这样，漕船大规模的出事，损失漕粮如此之多的情况，还是闻所未闻的。

朱载坖当然很清楚，这不是天灾，而是人祸，朱载坖将这些奏疏给阁部重臣们看过之后问道：“诸位怎么看此事啊？”

首辅张居正说道：“陛下，这是有人蓄意对抗朝廷，必须严惩！”

对于漕运出现这么严重的事故，总督漕运劳堪在请罪之外，也初步调查了本案，他认为虽然从表面上看起来此次漕船倾覆，是由于是本地水文情况复杂，运军又由于朝廷的改革命令而心神不宁，从而导致漕船倾覆，损失漕粮达二十余万石，但是劳堪也在奏疏中坦陈，此案个中缘由，尚且晦暗不明，不能排除有人蓄意破坏。

朱载坖将这些奏疏放下之后说道：“不急，先看看再说，朕倒是要看看，他们想玩些什么花样来。”

很快漕船倾覆，漕粮大量损失的消息就传遍了整个朝廷，科道御史们纷纷上疏，弹劾总督漕运劳堪和巡视漕运张学颜，甚至将获烧到了首辅张居正身上来了，很多人认为，之前漕运虽然有所损耗，但是从未发生如此大的损失，这都是由于张居正轻易变更祖制所导致的，现在运军人心惶惶，漕粮大量损失，对于朝廷的财政影响极大，必须要立刻做出反应，严惩涉事官吏，保证朝廷的漕粮和秋粮如数解运。

而原漕运总督，现